ड्राइव सिस्टम टेबलटॉप सेंट्रीफ्यूज का कोर होता है। हाई-स्पीड मोटर, ट्रांसमिशन गियर, रोटरी बेयरिंग, या स्लाइडिंग बेयरिंग जैसे किसी भी कंपोनेंट में कोई भी खराबी, इंस्ट्रूमेंट के नॉर्मल ऑपरेशन पर असर डालेगी। टेबलटॉप सेंट्रीफ्यूज ड्राइव सिस्टम में मुख्य असामान्यताओं में शामिल हैं: असामान्य आवाज़ें; जले हुए बेयरिंग; और हाई-स्पीड रोटेशन शाफ्ट में रुकावट। दूसरी असामान्यताओं में धीमी चढ़ाई की स्पीड, तेज़ कंपन, और ज़रूरी स्पीड तक न पहुँच पाना शामिल है; मोटर के लंबे समय तक हाई-स्पीड ऑपरेशन से बेयरिंग लुब्रिकेंट सूख जाता है, जिससे अजीब आवाज़ें और कंपन होते हैं, और स्पीड अस्थिर हो जाती है।
जब टेबलटॉप सेंट्रीफ्यूज लंबे समय तक हाई स्पीड पर चलता है, तो कार्बन ब्रश घिस जाते हैं और छोटे हो जाते हैं, प्रेशर स्प्रिंग ढीले हो जाते हैं, कार्बन ब्रश का चिपकना कम हो जाता है, कार्बन ब्रश और कम्यूटेटर के बीच रेजिस्टेंस बढ़ जाता है, और कार्बन डस्ट खराब हो जाती है। इन सभी वजहों से चिंगारियां निकल सकती हैं। जलता हुआ कम्यूटेटर "पॉप" डिस्चार्ज साउंड पैदा करेगा, जिससे मोटर के नॉर्मल ऑपरेशन पर असर पड़ेगा। हाई-स्पीड मोटर में शॉर्ट सर्किट, ओपन सर्किट और इंसुलेशन डैमेज होने से मोटर ओवरहीट हो जाएगी और स्टार्ट नहीं होगी।
अगर ऊपर बताई गई कोई भी अजीब बात होती है, तो बेंचटॉप सेंट्रीफ्यूज को रिपेयर के लिए तुरंत बंद कर देना चाहिए।
लैब में बेंचटॉप सेंट्रीफ्यूज के रोज़ाना के मेंटेनेंस में मुख्य रूप से सेंट्रीफ्यूज चैंबर को धूल और तेल से खराब होने से बचाना शामिल है। हर एक्सपेरिमेंट से पहले और बाद में, ग्रीस, पानी की भाप, सैंपल लीकेज और गंदगी हटाने के लिए सेंट्रीफ्यूज चैंबर और काम करने की जगह को एक साफ सफेद रेशमी कपड़े से साफ करें। इस्तेमाल न होने पर दरवाज़ा बिना ज़रूरत के न खोलें ताकि गंदगी न फैले। पक्का करें कि बेंचटॉप सेंट्रीफ्यूज की सीलिंग रिंग अच्छी सीलिंग परफॉर्मेंस बनाए रखें; इस्तेमाल के कुछ समय बाद वैक्यूम सीलिंग ग्रीस लगाएं। अगर सीलिंग रिंग पुरानी, टूटी हुई या लचीली न दिखें, तो उन्हें तुरंत बदल दें। पक्का करें कि कंट्रोल पैनल पर स्विच, नॉब और फॉल्ट इंडिकेटर अच्छे से जुड़े हों। अगर ऑपरेशन के दौरान कोई गड़बड़ी या खराबी दिखे, तो मशीन को तुरंत रिपेयर के लिए बंद कर दें।
दूसरा, बेंचटॉप सेंट्रीफ्यूज के सभी अंदरूनी सिस्टम का ध्यान से मेंटेनेंस किया जाना चाहिए और हर साल उनकी जांच की जानी चाहिए।
बेंचटॉप सेंट्रीफ्यूज के संदिग्ध हिस्सों की जांच की जानी चाहिए, और फाइलिंग कम्पार्टमेंट में गंदगी और धूल साफ की जानी चाहिए। जब लंबे समय तक इस्तेमाल न हो, तो ऑयल सर्कुलेशन कूलिंग सिस्टम को एक्टिवेट करने और पाइपों में रुकावट न हो, यह पक्का करने के लिए समय-समय पर सेंट्रीफ्यूज को चालू करें।
इसके अलावा, लंबे समय तक ऑपरेशन के दौरान, कुछ पानी कास्टिंग पंप में रिसकर तेल में मिल सकता है। इसलिए, हर मेंटेनेंस के दौरान, पानी निकालने के लिए वैक्यूम पंप के नीचे ड्रेन वाल्व खोलें। फिर, फ़नल को एथिलीन पाइप में ड्रेन पोर्ट पर डालें और वैक्यूम ऑयल तब तक डालें जब तक वह ऑयल लेवल गेज पर निशान तक न पहुँच जाए। अगर तेल निकालने से पहले बहुत गंदा या बहुत गहरा हो, तो तेल निकाल दें और बदल दें।
ऊपर बताया गया मेंटेनेंस करने के बाद, चेक करें कि ऑयल पैन के नीचे एथिलीन पाइप में तेल भरा है या नहीं। अगर तेल जमा होता है, तो यह ऑयल मिस्ट सेपरेटर में रुकावट का संकेत है। ऑयल मिस्ट सेपरेटर का ऊपरी स्क्रू खोलें, ऊपरी कवर हटाएँ, फ़िल्टर एलिमेंट निकालें, और सेंट्रीफ़्यूज चैंबर के अंदर वैक्यूम लेवल बदलें। वैक्यूम लेवल ज़्यादा है या कम, यह न सिर्फ़ वैक्यूम पंप के काम करने और खराब होने पर निर्भर करता है, बल्कि इंस्ट्रूमेंट के दरवाज़े, शाफ़्ट सील और पाइप सील की सीलिंग रिंग पर भी निर्भर करता है। अगर सेंट्रीफ़्यूज में पानी का लीकेज मिलता है, खासकर अनदेखी जगहों और कनेक्शन में, तो उसे तुरंत ठीक करें।